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聚乙二醇(PEG-8000)沉淀法常压浓缩慢病毒与逆转录病毒
涉及器物/材料:PEG-8000、高浓度氯化钠(NaCl)、4 ℃ 冰箱、常规台式高速冷冻离心机
你知道吗?
病毒在稀薄的水相中不可捉摸,但只要加入足够多的大分子高聚物,水就会被占满,逼迫病毒乖乖抱团沉淀。
背景与痛点
在构建稳转株、进行 CRISPR 全基因组筛选文库递送或感染原代免疫细胞(如 T 细胞、巨噬细胞)时,高滴度()的慢病毒是决定实验成败的生命线。然而,293T 细胞三质粒或四质粒共转染包装后收集的未经浓缩上清,初始滴度通常仅有 。传统浓缩方案必须依赖超速离心机在 下超离 2 小时,多数中小型实验室根本没有昂贵的高端超离设备和专用水桶转子;而市售浓缩柱(Amicon 滤膜管)极易发生严重堵孔和膜不可逆吸附蛋白损失。
巧思与生物高分子排阻机制
2009 年 Kutner 等人在 Nature Protocols 系统确立的 PEG 沉淀浓缩法,基于经典高分子物理化学中的热力学体积排阻效应(Volume Exclusion Effect):
- 大分子链夺取溶剂自由水:聚乙二醇 8000(PEG-8000)是无毒的长链非离子型亲水聚合物。溶解在溶液中时,PEG 的大量螺旋链束占据了绝大部分溶液自由水体积,并将周围自由水分子紧密水合。
- 表面电荷屏蔽促聚集:病毒颗粒(外包被囊膜直径约 )在水溶液中本靠负电荷相互排斥稳定悬浮。在 高离子强度下,电荷双电层被屏蔽;由于周围没有足够自由水接纳外包被囊膜,大量病毒颗粒在熵驱动下发生疏水自组装相分离,形成肉眼可见的微小聚集体。这种大聚集体只需在普通台式离心机()即可彻底沉淀到底部。
5× PEG 沉淀母液配方与实操规程
5× PEG-IT 沉淀浓缩液配制(100 mL)
- PEG-8000 粉末:(终质量浓度 )
- 氯化钠(NaCl):(终浓度约 )
- 加入超纯水加热促溶至 ,微波低火或 水浴温育搅拌至澄清透明。
- 高压蒸汽灭菌(,20 分钟),灭菌后可 长期存放数年。
简易浓缩标准化流程
- 上清收获与粗滤:在转染 48 小时与 72 小时分别收集 293T 细胞的慢病毒上清,以 离心 5 分钟 沉淀漂浮的细胞碎屑;上清经 针头滤器过滤(严禁用 滤膜,因囊膜糖蛋白过大易被截留)。
- 加液混匀与 4 ℃ 孵育:
- 按 4 份病毒上清 : 1 份 5× PEG 母液 的体积比例混合(例如 20 mL 上清加入 5 mL PEG 浓缩液)。
- 上下颠倒轻柔混匀 10 次,置于 冰箱避光静置孵育过夜(或至少 8~12 小时)。
- 低速离心沉淀:
- 第二天将离心管置于常规冷冻离心机中,以 ()离心 30 分钟。
- 离心结束后,可在管底和管壁侧面清晰观察到米白色到米黄色的细小沉淀物。
- 重悬与分装保存:
- 极其缓慢地倾倒或用移液枪吸尽上清,倒立在吸水纸上沥干 1 分钟。
- 向沉淀中加入初始体积的 的无菌冷 或 Opti-MEM 培养基(例如 20 mL 初始上清加入 PBS)。
- 冰上轻柔吹打数次使其完全溶解,小体积(/管)分装,立即放入 冻存,避免反复冻融。